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苏建忠

发布时间:2020-04-22 14:03:12 浏览量:4548

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苏建忠教授

苏建忠博士,教授、博士生导师,温州医科大学生物医学大数据研究所所长,中国科学院大学温州研究院研究员,国家“四青人才”,浙江省“杰出青年基金”获得者。主持国家自然科学面上项目、国家自然科学重点基金子课题等科研课题。博士毕业哈尔滨工业大学数学系,主要从事复杂疾病的遗传和表观遗传数据挖掘,液体活检分子标志物鉴定,单细胞大数据处理和分析智能算法开发等方面的研究工作。开发在线算法工具和数据库10个,发表高水平SCI论文40余篇(累计影响因子300余点)。其中第一或通讯作者在Nature Genetics、Blood、Nature Communications、Genome Biology及Nucleic Acids Research等国际高水平期刊发表研究论文12篇,H指数21。获省部级科研奖项2项,多次在国内外学术会议发言,参与生物医学信息学论著一项。担任中国抗癌协会骨与软组织肿瘤热疗及生物信息专业委员会常务委员,浙江省生物信息学会理事,中国抗癌协会肿瘤标志物专业委员会委员,CCF生物信息专委会委员等学术职务。

个人网站:www.su-lab.org。电子邮箱:sujz(at)wmu.edu.cn。办公电话:0577-88068273。


研究经历

1. 2018年2月-至今 温州医科大学生物医学大数据研究所 所长、教授、博士生导师

2. 2018年2月-至今 中国科学院大学温州研究院PI、研究员、博士生导师

3. 2014年2月-2018年2月 美国贝勒医学院DanL.Duncan癌症中心 博士后

4. 2013年8月-2014年2月 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 副教授

5. 2009年8月-2013年7月 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 讲师

6. 2007年7月-2009年7月 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 助教


承担科研项目

1. 入选国家中组部人才项目,支持经费: 300万,2019.1.1-2021.12.31。

2. 国家自然科学基金重点项目: 先天性脊柱侧凸关键遗传调控网络的发现及机制研究 起止时间:2020,01-2024,12,300万元,子课题负责人

3. 浙江省自然科学基金杰青项目: 癌症表观基因组生物标志物识别研究 起止时间:2019,01-2022,12,73万元,项目负责人

4. 国家自然科学基金面上项目: 泛癌症异常DNA甲基化标志物识别及其调控机制研究 起止时间:2019,01-2022,12,63万元,项目负责人

5. 国家自然科学基金青年项目: 高通量DNA甲基化数据中识别功能组区域的算法研究 起止时间:2013,01-2015,12,27万元,项目负责人

6. 黑龙江省自然科学基金青年项目: 细胞分化过程表观遗传特征挖掘 起止时间:2012.01-2014.12,10万元,项目负责人


代表性研究论文(*共同一作,#共同通信)

1. Yu F*, Li  K*, Li S*, Liu J,  Zhang Y,  Zhou M,  Zhao H, Chen H, Wu N, Liu Z#, Su J#: CFEA: a cell-free epigenome atlas in human diseases. Nucleic Acids Research 2020, Nucleic acids research 48 (D1), D40-D44. (中科院一区,IF=11.6))

2. Zhang X*#, Wang X*, Wang X, Su J#, Putluri N, Zhou T, Qu Y, Jeong M, Guzman A, Rosas C, Huang Y, Sreekumar A, Li W, Goodell MA: Dnmt3a loss and Idh2 neomorphic mutations mutually potentiate malignant hematopoiesis. Blood 2020, 135 (11): 845–856. (中科院一区,IF=16.56,封面)

3. Zhou M*, Zhao H*, Wang X, Sun J#, Su J#: Analysis of long noncoding RNAs highlights region-specific altered expression patterns and diagnostic roles in Alzheimer's disease. Briefings in Bioinformatics 2019, 20(2): 598-608. (中科院一区,IF= 9.1)

4. Yuan J*, Li Y*, Xu Y, Sun B, Shao J, Zhang D, Li K, Fan D, Xue Z, Chen W, Clara P, Lou Y, Su J#, Zheng M#. Molecular signatures related to the virulence of Bacillus cereus sensulato; a leading cause of devastating endophthalmitis. mSystems 2019, 4(6): e00745-19. (中科院二区,IF= 6.5)

5. Bao S*, Zhao H, Yuan J, Fan D, Zhang Z, Su J#, Zhou M#. Computational identification of mutator-derived lncRNA signatures of genome instability for improving the clinical outcome of cancers: a case study in breast cancer. Briefings in Bioinformatics 2019, DOI: 10.1093/bib/bbz118. (中科院一区,IF= 9.1)

6. Sun J*, Zhao H*, Lin S*, Zhang Y, Su J#, Zhou M#.  Integrative analysis from multi‐centre studies identifies a function‐derived personalized multi‐gene signature of outcome in colorectal cancer. Journal of cellular and molecular medicine 2019, 23(8): 5270-5281. (中科院二区,IF= 4.6)

7. Su J*#, Huang Y*, Cui X, Zhang X, Wang X, Xin Y, Lin Xue, Chen K, Lv J, Xu J, Goodell MA# and Li W#: Homebox oncogene activation by pan-cancer DNA hypermethylation. Genome Biology 2018, 19:108. (中科院一区,IF=13.2)

8. Huang Y*, Su J*, Lei Y, Brunetti L, Gundry MC, Zhang X, Jeong M, Li W#, Goodell MA#: DNA epigenome editing using CRISPR-Cas SunTag-directed DNMT3A. Genome Biology 18 (2017) 176. (中科院一区,IF=13.2)

9. Lei Y*, Zhang X*, Su J*, Jeong M, Gundry MC, Huang YH, Zhou Y, Li W#, Goodell MA#: Targeted DNA methylation in vivo using an engineered dCas9-MQ1 fusion protein. Nature Communications 8 (2017) 16026. (中科院一区,IF=12.3)

10. Zhang X*, Su J* , Jeong M*, Ko M, Huang Y, Park HJ, Guzman A, Lei Y, Huang YH, Rao A, Li W#, Goodell MA#: DNMT3A and TET2 compete and cooperate to repress lineage-specific transcription factors in hematopoietic stem cells. Nature Genetics (2016) 48(9): 1014–1023. (中科院一区,IF=27.1)

11. Su J*, Yan H*, Wei Y, Liu H, Wang F, Lv J, Wu Q#, Zhang Y#: CpG_MPs: identification of CpG methylation patterns of genomic regions from high-throughput bisulfite sequencing data. Nucleic Acids Research 2013, 41(1):e4. (中科院一区,IF=11.6)

12. Lv J*, Liu H*, Su J*, Wu X, Li B, Xiao X, Wang F, Wu Q#, Zhang Y#: DiseaseMeth: a human disease methylation database. Nucleic Acids Research 2012, 40(Database issue):D1030-1035. (中科院一区,IF=11.6)

13. Su J*, Zhang Y*#, Lv J*, Liu H, Tang X, Wang F, Qi Y, Feng Y, Li X#: CpG_MI: a novel approach for identifying functional CpG islands in mammalian genomes. Nucleic Acids Research 2010, 38(1):e6. (中科院一区,IF=11.6)

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