COVID-19病毒是一种新型冠状流感病毒正在全球范围内蔓延。截止到2022年2月18日，全球累计确诊病例超过3.88亿人，新冠导致累计死亡病例超过560万人。COVID-19病毒大流行正破坏着全球的经济和卫生系统。迫切的需要深入了解COVID-19传染途径、重症发生机制及对卫生系统的影响。

温医大眼视光医院、生物医学大数据研究所苏建忠、瞿佳教授团队，结合基因型和表型组学大数据挖掘发现：眼角膜是SRAS-CoV-2病毒受体基因ACE2和TMPRSS2与新冠易感因子（SLC6A20, LZTFL1, CCR9, FYCO1, CXCR6 和 XCR1）在角膜中共表达，作为进入人体的潜在新途径 （IOVS，2020）；运用百万温州中小学COVID-19隔离近视模型，发现疫情前后等效球镜由-0.23D进展至-0.343D，近视半年发生率从8.5%增加到13.62%，近视加重与新冠隔离期间学生网上学习增加、户外活动时间降低密切相关（Ophthalmology, 2021）；发现基因簇21q22.11是COVID-19新的遗传易感性位点，基因IFNAR2和IL10RB的干扰素是COVID-19潜在治疗药物（Human Molecular Genetics, 2021）。

COVID-19 的死亡率主要来自双肺间质性肺炎和急性呼吸窘迫综合征的重症患者，揭示重症 COVID-19 的免疫机制并确定新的疫苗靶点以控制死亡率具有重要意义。近日该团队通过结合近百万人GWAS数据和60万个细胞的单细胞测序数据挖掘宿主遗传基因调控的免疫细胞对重症COVID-19的影响。发现CD16+单核细胞、巨核细胞和记忆CD8+T细胞更容易受到遗传因素对重症患者的影响。遗传易感基因CCR1+ CD16+ 单核细胞和 ABO+ 巨核细胞在重症患者的细胞因子风暴中发挥更重要的作用；CXCR6+ 记忆 CD8+T 细胞具有增强的多功能性和活化 T 细胞的倾向及肺气道驻留能力，以抵抗SARS-CoV-2病毒的感染。系统揭示了遗传调节免疫反应在轻度和重度新冠之间发生显著转变，主要包括遗传风险基因表达升高、炎性细胞因子增加和功能性免疫细胞亚群加重COVID-19的严重程度，这为解析宿主遗传因素影响重症 COVID-19免疫反应提供了新的见解。相关研究成果《Integrating single cell sequencing data with GWAS summary statistics reveals CD16+monocytes and memory CD8+T cells involved in severe COVID-19》发表在国际权威期刊《Genome Medicine》上。

文章地址：https://genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13073-022-01021-1

参考文献:

1、Ma Y, Qiu F, Deng C, Li J, Huang Y, Wu Z, ZhouY, Zhang Y, Xiong Y, Yao Y, Zhong Y, Qu J, Su J. Integrating single cell sequencing data with GWAS summary statisticsreveals CD16+monocytes and memory CD8+T cells involved in severe COVID-19. Genome Medicine, 2022. Online.

2、Xu L, Ma Y, Yuan J, Zhang Y, Wang H, Zhang G, TuC, Lu X, Li J, Xiong Y, Chen F, Liu X, Xue Z, Zhou M, Li W, Wu N, Bao J, ChenH, Lu F, Su J, Qu J. COVID-19 quarantine revealsbehavioral changes effect on myopia progression. Ophthalmology,2021, S0161-6420(21)00257-8.

3、Ma Y, Huang Y, Zhao S, Yao Y, Zhang Y, Qu J, WuN, Su J. Integrative genomics analysisreveals a 21q22.11 locus contributing to susceptibility of COVID-19. Human Molecular Genetics, 2021 May 5; ddab125.

4、Yuan J, Fan D, Xue Z, Qu J, Su J. Co-expression of Mitochondrial Genes andACE2 in Cornea Involved in COVID-19, Investigative Ophthalmology &Visual Science. 2020, 61(12):13.